Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il6stQ00560 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Il6stQ00560 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Il6stQ00560 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms