Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx1P83917 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx1P83917 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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