Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fdft1P53798 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fdft1P53798 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fdft1P53798 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fdft1P53798 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fdft1P53798 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fdft1P53798 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms