Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab11bP46638 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms