Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sept1P42209 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sept1P42209 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept1P42209 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept1P42209 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms