Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6aP27664 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms