Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Myo5bP21271 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo5bP21271 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5bP21271 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5bP21271 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms