Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CatspereP0DP43 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CatspereP0DP43 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms