Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Becn2P0DM65 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms