Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Surf1P09925 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Surf1P09925 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Surf1P09925 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf1P09925 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Surf1P09925 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms