Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col3a1P08121 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col3a1P08121 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col3a1P08121 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col3a1P08121 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms