Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna1P04756 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna1P04756 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chrna1P04756 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms