Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC1P02654 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOC1P02654 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOC1P02654 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOC1P02654 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOC1P02654 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOC1P02654 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOC1P02654 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOC1P02654 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOC1P02654 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOC1P02654 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms