Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp8O89110 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casp8O89110 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Casp8O89110 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casp8O89110 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms