Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brd7O88665 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms