Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Supt5hO55201 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Supt5hO55201 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Supt5hO55201 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms