Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf148G3X9R7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms