Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pate1E9Q658 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pate1E9Q658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pate1E9Q658 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms