Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sbf2E9PXF8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbf2E9PXF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbf2E9PXF8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms