Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VWC2LB2RUY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VWC2LB2RUY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VWC2LB2RUY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms