Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga8A2ARA8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga8A2ARA8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms