Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Gde1Q9JL56 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gde1Q9JL56 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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