Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CsprsQ99388 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms