Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms