Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctsll3Q3ULP7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms