Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc10Q3TLI0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc10Q3TLI0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms