Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX4Q06945 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX4Q06945 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms