Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx2P81066 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms