Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOBEC1P41238 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms