Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Opn1mwO35599 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Opn1mwO35599 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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