Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf11cB4XVP9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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