Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM54Q9BYV2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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