Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PERM1Q5SV97 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms