Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms