Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PLOD1Q02809 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms