Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrig1P70193 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms