Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP46P62068 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP46P62068 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP46P62068 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP46P62068 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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USP46P62068 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP46P62068 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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USP46P62068 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP46P62068 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP46P62068 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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