Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF2Q9UG63 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms