Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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EFEMP1Q12805 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFEMP1Q12805 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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