Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNB2Q08289 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms