Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms