Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprtQ99M80 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms