Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms