Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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