Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms