Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18532 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P18532 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms