Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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