Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Trabd2bB1ATG9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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