Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms