Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms